Nové Mexiko je jedním z největších producentů chilli papričky (Capsicum spp.) ve Spojených státech s 51,000 2021 tunami produkce v roce 8500 z oblasti 6 akrů s průměrnou produktivitou 25 tun/akr podle amerického ministerstva zemědělství National Zemědělská statistická služba. Průměrná produktivita se snížila o 10 %, protože plocha osázená pro produkci chilli papriček zůstala stejná. To vedlo v roce 2020 ke snížení ekonomické aktivity o téměř 50.1 % ve srovnání s předchozím rokem, z 44.9 milionu USD na XNUMX milionu USD. Tento významný pokles celkové produkce chilského pepře ve státě podnítil vědce k novým modernizačním snahám zaměřeným na urychlení genetického zisku a zlepšení produktivity v programu NMSU Chile Pepper Breeding and Genetics vyhodnocením různých vlastností souvisejících s výnosem a výnosovým potenciálem pomocí vysoce kvalitních nástroje pro fenotypování, jako je Tomato Analyzer (TA).
Architektura ovoce a znaky související s morfologií patří mezi determinanty rozmanitosti ovoce a jsou hlavními přispěvateli k výnosu a výnosovému potenciálu chilli papričky. Pomocí softwaru TA vědci shromáždili data o sadě atributů ovoce včetně obvodu ovoce, indexů tvaru, velikosti a asymetrie ve sbírce různých linií chilli papričky hodnocených v podmínkách pěstování v Novém Mexiku.
Výzkumníci chtěli charakterizovat 105 genotypů panelu diverzity Capsicum sestávajícího z kultivarů, šlechtitelských linií, krajové rasy a divoké druhy patřící k 12 různým typům lusků (ovoce), pro 32 morfometrických deskriptorů TA. Hierarchická shluková analýza seskupila genotypy do osmi shluků na základě TA deskriptorů. Základní rozměry — jmenovitě obvod, plocha, šířka střed výška, maximální šířka, výška střed šířka, maximální výška, a zakřivená výška – byly nejvíce rozlišujícími deskriptory s maximálním příspěvkem k celkovému tvaru ovoce.
Byla prokázána užitečnost morfometrických deskriptorů TA, které je obtížné měřit konvenčním fenotypováním. Několik kultivarů s požadovaným tvarem a morfologií plodů na základě shlukových analýz bylo doporučeno jako rodičovské linie pro hybridizaci pro zlepšení výnosu v programech šlechtění chilli papričky. Výsledky využívající TA pro měření vlastností souvisejících s ovocem poskytnou základ pro asociační studie pro celý genom a genomická selekce pro výnos a vlastnosti přispívající k výnosu u novomexické chilli papričky.