Nedávný článek ve vědeckém časopise 'Plants' analyzuje současnou spolupráci mezi genovými bankami v Evropě. Příspěvek společně napsali vedoucí genové banky rostlin CGN, tajemník Evropského kooperativního programu pro rostlinné genetické zdroje (ECPGR) a bývalý koordinátor iniciativy virtuální evropské genové banky (AEGIS). Tato sebereflexe vyústila v podrobnou práci s jasnými závěry.
Spolupráce v Evropě
Evropský kooperativní program pro rostlinné genetické zdroje (ECPGR), zastřešující organizace evropských zemí v oblasti rostlinných genetických zdrojů, rozvinul v posledních čtyřech desetiletích mnoho cenných společných aktivit mezi evropskými genovými bankami. To však nevedlo k výraznému posílení spolupráce.
Pro zlepšení této situace byl v roce 2004 založen AEGIS (zkratka pro: 'A European Genebank Integrated System'). AEGIS je iniciativa ECPGR, jejímž cílem je efektivně uchovat a poskytnout přístup k jedinečné zárodečné plazmě v Evropě. Jde o virtuální genovou banku, která spravuje „Evropskou sbírku“, sestávající z přírůstků spravovaných členy AEGIS (genové banky), kteří organizují a hradí náklady na dlouhodobé uchovávání a distribuci těchto přírůstků. S materiálem v AEGIS se má zacházet v souladu s dohodnutými standardy kvality a měl by být volně dostupný v souladu s podmínkami stanovenými v Mezinárodní smlouvě o rostlinných genetických zdrojích pro výživu a zemědělství.
Za účelem analýzy a vyhodnocení spolupráce napsali Theo van Hintum, vedoucí genové banky rostlin CGN, Lorenzo Maggioni, tajemník Evropského kooperativního programu pro rostlinné genetické zdroje (ECPGR), a Johannes Engels, bývalý koordinátor AEGIS. nedávno publikovaný článek „AEGIS, virtuální evropská genová banka: proč je to tak dobrý nápad, proč nefunguje a jak by se dal zlepšit“. Článek popisuje historii konzervace rostlinných genetických zdrojů (PGR) v Evropě a proč se spolupráce mezi genovými bankami od založení ECPGR výrazně nezlepšila. Autoři pozorují, že (1) genetické zdroje rostlin jsou často duplikovány v mnoha sbírkách, zatímco jiný důležitý materiál chybí, (2) přístup k materiálům, pokud vůbec existuje, je často omezen na malou skupinu lidí, jako je např. kolegy v ústavu, partneři projektu nebo členové omezené sítě, a co je nejdůležitější, (3) kvalita konzervačních metodologií a konzervovaného materiálu je nejasná a možná často velmi nízká.
Proč AEGIS nefunguje
Autoři pozorují, že AEGIS zatím není úspěšný. Do této virtuální genové banky bylo zahrnuto příliš málo materiálu: 65,267 3.2 přístupů, což je pouze XNUMX % materiálu registrovaného v EURISCO, evropské databázi pro materiál genové banky. Je to hlavně proto, že neexistují žádné řádné pobídky pro zařazení materiálu do AEGIS a zdá se, že genové banky se zdráhají zavázat se k požadovaným standardům kvality bez takových pobídek. Rovněž není zajištěna kvalita a přístup k přiloženému materiálu, protože neexistuje žádný mechanismus, který by ověřoval shodu se standardy kvality.
Jak by se to dalo zlepšit
Genebanky se nemohou a nebudou spoléhat jedna na druhou, pokud si nemohou být jisti kvalitou a kontinuitou sbírek spravovaných jejich kolegy genovými bankami. Proto je zdůrazněna potřeba zavedení systému kvality, ve kterém by genové banky mohly získat certifikaci AEGIS. Výsledkem takového systému by bylo, že genové banky certifikované AEGIS se samy kvalifikují pro podporu na národní a regionální úrovni, protože by měly být spolehlivými přispěvateli k zachování genetických zdrojů. Instituce, které se chtějí stát genovými bankami certifikovanými podle AEGIS, ale zatím nesplňují požadavky, by měly být podporovány ECPGR a dalšími dárci, aby tohoto cíle dosáhly budováním kapacit, výměnami zaměstnanců, podporou zřizování požadovaných zařízení atd.
Kontinuita sbírek by mohla být realizována vytvořením „otevřeného záložního systému“. Bezpečnostní zálohování je standardní činností pro všechny dobře fungující genové banky; posílají vzorky svého materiálu do kolegy genové banky a do Svalbard Global Seed Vault. V současnosti se to však děje v black-boxových konstrukcích, ke kterým má přístup pouze dárce materiálu. Autoři navrhují mírnou změnu tohoto postupu tím, že souhlasí s tím, že přírůstky v záložní genové bance mohou být použity pro zařazení do jiné kolekce AEGIS-genové banky v nežádoucím případě, že původní holdingová genová banka již nebude moci poskytovat přístup k těmto přírůstkům.
Autoři docházejí k závěru, že evropská komunita genových bank má zjevně touhu po profesionalizaci a spolupráci. Autoři věří, že vytvořením vhodných pobídek a vytvořením správné infrastruktury podporované financujícími agenturami a tvůrci politik lze v Evropě vytvořit účinný systém spolupracujících genových bank.
Pro více informací:
Wageningen University & Research
www.wur.nl